MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 31828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	383493133
2	NC_017053	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	383493133
3	NC_017053	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493133
4	NC_017053	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	383493133
5	NC_017053	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493133
6	NC_017053	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
7	NC_017053	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	383493133
8	NC_017053	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493133
9	NC_017053	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493133
10	NC_017053	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493133
11	NC_017053	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	383493133
12	NC_017053	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493133
13	NC_017053	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	383493133
14	NC_017053	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493133
15	NC_017053	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	383493133
16	NC_017053	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	383493133
17	NC_017053	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
18	NC_017053	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493133
19	NC_017053	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	383493133
20	NC_017053	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493133
21	NC_017053	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
22	NC_017053	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383493133
23	NC_017053	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	383493133
24	NC_017053	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493133
25	NC_017053	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493133
26	NC_017053	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493133
27	NC_017053	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383493133
28	NC_017053	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493133
29	NC_017053	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	383493133
30	NC_017053	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
31	NC_017053	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493134
32	NC_017053	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	383493134
33	NC_017053	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
34	NC_017053	T	7	7	1981	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	383493134
35	NC_017053	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
36	NC_017053	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493134
37	NC_017053	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493134
38	NC_017053	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493134
39	NC_017053	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
40	NC_017053	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
41	NC_017053	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493134
42	NC_017053	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	383493134
43	NC_017053	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493134
44	NC_017053	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	383493134
45	NC_017053	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493134
46	NC_017053	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493134
47	NC_017053	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493134
48	NC_017053	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493134
49	NC_017053	CTT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493134
50	NC_017053	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	383493134
51	NC_017053	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	383493134
52	NC_017053	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493134
53	NC_017053	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	383493134
54	NC_017053	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	383493134
55	NC_017053	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	383493135
56	NC_017053	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	383493135
57	NC_017053	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493135
58	NC_017053	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	383493135
59	NC_017053	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493136
60	NC_017053	GCT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493136
61	NC_017053	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	383493136
62	NC_017053	A	7	7	3661	3667	100 %	0 %	0 %	0 %	383493136
63	NC_017053	TGA	3	9	3801	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493136
64	NC_017053	TCAA	2	8	3907	3914	50 %	25 %	0 %	25 %	383493136
65	NC_017053	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	383493136
66	NC_017053	AGA	2	6	4047	4052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
67	NC_017053	GTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493136
68	NC_017053	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493136
69	NC_017053	CAAA	2	8	4161	4168	75 %	0 %	0 %	25 %	383493136
70	NC_017053	AGT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493136
71	NC_017053	AGA	3	9	4224	4232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
72	NC_017053	AGA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
73	NC_017053	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493136
74	NC_017053	ATC	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493136
75	NC_017053	CAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493136
76	NC_017053	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493136
77	NC_017053	TAT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493136
78	NC_017053	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493136
79	NC_017053	AAG	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
80	NC_017053	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493136
81	NC_017053	TGT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493136
82	NC_017053	CAT	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493136
83	NC_017053	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383493137
84	NC_017053	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	383493137
85	NC_017053	GAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493137
86	NC_017053	TTA	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493137
87	NC_017053	CTA	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493137
88	NC_017053	AAT	2	6	4867	4872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493137
89	NC_017053	CTA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493137
90	NC_017053	ATG	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493137
91	NC_017053	TTACGT	2	12	4969	4980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383493137
92	NC_017053	CAG	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493137
93	NC_017053	GAC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493137
94	NC_017053	TTA	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493137
95	NC_017053	TCAAT	2	10	5115	5124	40 %	40 %	0 %	20 %	383493137
96	NC_017053	TTTA	2	8	5183	5190	25 %	75 %	0 %	0 %	383493137
97	NC_017053	A	6	6	5207	5212	100 %	0 %	0 %	0 %	383493137
98	NC_017053	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
99	NC_017053	ACC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383493138
100	NC_017053	GAT	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
101	NC_017053	A	9	9	5380	5388	100 %	0 %	0 %	0 %	383493138
102	NC_017053	TGA	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
103	NC_017053	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	383493138
104	NC_017053	TGA	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
105	NC_017053	TTA	2	6	5737	5742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
106	NC_017053	T	6	6	5820	5825	0 %	100 %	0 %	0 %	383493138
107	NC_017053	TGA	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
108	NC_017053	AAC	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493138
109	NC_017053	GAT	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
110	NC_017053	A	6	6	5994	5999	100 %	0 %	0 %	0 %	383493138
111	NC_017053	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
112	NC_017053	A	6	6	6029	6034	100 %	0 %	0 %	0 %	383493138
113	NC_017053	ATT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
114	NC_017053	ATT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383493138
115	NC_017053	T	6	6	6129	6134	0 %	100 %	0 %	0 %	383493138
116	NC_017053	GAT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
117	NC_017053	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	383493138
118	NC_017053	AGA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383493138
119	NC_017053	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383493138
120	NC_017053	CTT	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383493138
121	NC_017053	T	6	6	6369	6374	0 %	100 %	0 %	0 %	383493138
122	NC_017053	TTGA	2	8	6390	6397	25 %	50 %	25 %	0 %	383493138
123	NC_017053	A	7	7	6415	6421	100 %	0 %	0 %	0 %	383493138
124	NC_017053	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383493138
125	NC_017053	ACGA	2	8	6463	6470	50 %	0 %	25 %	25 %	383493138
126	NC_017053	CCTT	2	8	6503	6510	0 %	50 %	0 %	50 %	383493138
127	NC_017053	AGTG	2	8	6512	6519	25 %	25 %	50 %	0 %	383493138
128	NC_017053	TGA	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
129	NC_017053	ACG	2	6	6641	6646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383493138
130	NC_017053	GATTCA	2	12	6764	6775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383493138
131	NC_017053	TAG	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
132	NC_017053	CTG	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383493138
133	NC_017053	TAA	2	6	6896	6901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383493138
134	NC_017053	ATG	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
135	NC_017053	TGA	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383493138
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